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如何分析python程序的性能

python admin 6469浏览 0评论

 

  • 获取程序运行的大概时间
  • 获取更精确的程序运行时间
  • 计算每一行代码的运行时间和运行频率
  • 找到程序运行时占用多少内存
  • line_profiler 和memory_profiler在IPython中的简便实用方法
  • 找到内存泄露的地方
  • 获取使用最多的前20个对象
  • 获取增加和删除的对象
  • 那些对象被引用

程序性能分析需要基本上需要搞清楚4个问题

  1. 程序到底有多快
  2. 程序的瓶颈到底在哪里
  3. 程序占用内存多少
  4. 是否存在内存泄露

下面我们使用一些工具来回答以上四个问题。

获取程序运行的大概时间

在linux平台上,可以使用time命令得到程序运行的大概时间:

$ time python yourprogram.py

real    0m1.028s
user    0m0.001s
sys     0m0.003s

简短的来说,其输出的结果说明:

  • real – 程序实际运行的时间
  • user – 用户空间话费的cpu时间
  • sys – 内核空间话费的cpu时间

如果sysuser之和的时间远远小于real的时间,那么说明程序大部分的时间很可能花费在IO等待。

获取更精确的程序运行时间

下面我们通过封装一个Timer类来实现获取更精确地程序运行时间

import time

class Timer(object):
    def __init__(self, verbose=False):
        self.verbose = verbose

    def __enter__(self):
        self.start = time.time()
        return self

    def __exit__(self, *args):
        self.end = time.time()
        self.secs = self.end - self.start
        self.msecs = self.secs * 1000  # millisecs
        if self.verbose:
            print 'elapsed time: %f ms' % self.msecs

为了使用我们封装的类,必须使用with来封装我们需要计算的代码块,这样当代码块开始时,计时器开始,当代码块结束时计时器停止。

这是一个使用上述代码片段的例子:

from timer import Timer
from redis import Redis
rdb = Redis()

with Timer() as t:
    rdb.lpush("foo", "bar")
print "=> elasped lpush: %s s" % t.secs

with Timer as t:
    rdb.lpop("foo")
print "=> elasped lpop: %s s" % t.secs

可以将时间输出到文件中,已查看程序的时常运行时间。

计算每一行代码的运行时间和运行频率

这里我们需要使用line_profiler模块,首先安装该模块:

pip install line_profiler

为了使用该模块,需要将@profile添加到你需要观察的函数头部。

primes.py

@profile
def primes(n):
    if n==2:
        return [2]
    elif n<2:
        return []
    s=range(3,n+1,2)
    mroot = n ** 0.5
    half=(n+1)/2-1
    i=0
    m=3
    while m <= mroot:
        if s[i]:
            j=(m*m-3)/2
            s[j]=0
            while j<half:
                s[j]=0
                j+=m
        i=i+1
        m=2*i+3
    return [2]+[x for x in s if x]
primes(100)

使用kernprof.py运行python脚本:

$ kernprof.py -l -v fib.py

-l参数是告诉kernprof.py测试头部有@profile的函数,-v参数是告诉kernprof.py当脚本运行完毕时打印出时间信息。以下是告诉kernprof.py的输出信息样本:

Wrote profile results to primes.py.lprof
Timer unit: 1e-06 s

File: primes.py
Function: primes at line 2
Total time: 0.00019 s

Line #      Hits         Time  Per Hit   % Time  Line Contents
==============================================================
     2                                           @profile
     3                                           def primes(n):
     4         1            2      2.0      1.1      if n==2:
     5                                                   return [2]
     6         1            1      1.0      0.5      elif n<2:
     7                                                   return []
     8         1            4      4.0      2.1      s=range(3,n+1,2)
     9         1           10     10.0      5.3      mroot = n ** 0.5
    10         1            2      2.0      1.1      half=(n+1)/2-1
    11         1            1      1.0      0.5      i=0
    12         1            1      1.0      0.5      m=3
    13         5            7      1.4      3.7      while m <= mroot:
    14         4            4      1.0      2.1          if s[i]:
    15         3            4      1.3      2.1              j=(m*m-3)/2
    16         3            4      1.3      2.1              s[j]=0
    17        31           31      1.0     16.3              while j<half:
    18        28           28      1.0     14.7                  s[j]=0
    19        28           29      1.0     15.3                  j+=m
    20         4            4      1.0      2.1          i=i+1
    21         4            4      1.0      2.1          m=2*i+3
    22        50           54      1.1     28.4      return [2]+[x for x in s if x]

根据上面的输出,找到运行最多的代码行或者运行时间最长的代码来优化,定会提升程序的性能。

找到程序运行时占用多少内存

现在我们已经知道如何测试程序的运行时间,接下来看看如何得知程序占用的内存,我们需要安装使用到的模块memory_profiler:

$ pip install -U memory_profiler
$ pip install psutil

(安装psutil会很大程度上提高memory_profiler的性能。)

和前面说过的一样,为了得到函数占用的内存,需要在函数头部添加@profile,如下:

@profile
def primes(n):
    ...
    ...

用下面的命令运行你的脚本:

$ python -m memory_profiler primes.py

你会得到像下面这样的输出:

Filename: primes.py

Line #    Mem usage  Increment   Line Contents
==============================================
     2                           @profile
     3    7.9219 MB  0.0000 MB   def primes(n):
     4    7.9219 MB  0.0000 MB       if n==2:
     5                                   return [2]
     6    7.9219 MB  0.0000 MB       elif n<2:
     7                                   return []
     8    7.9219 MB  0.0000 MB       s=range(3,n+1,2)
     9    7.9258 MB  0.0039 MB       mroot = n ** 0.5
    10    7.9258 MB  0.0000 MB       half=(n+1)/2-1
    11    7.9258 MB  0.0000 MB       i=0
    12    7.9258 MB  0.0000 MB       m=3
    13    7.9297 MB  0.0039 MB       while m <= mroot:
    14    7.9297 MB  0.0000 MB           if s[i]:
    15    7.9297 MB  0.0000 MB               j=(m*m-3)/2
    16    7.9258 MB -0.0039 MB               s[j]=0
    17    7.9297 MB  0.0039 MB               while j<half:
    18    7.9297 MB  0.0000 MB                   s[j]=0
    19    7.9297 MB  0.0000 MB                   j+=m
    20    7.9297 MB  0.0000 MB           i=i+1
    21    7.9297 MB  0.0000 MB           m=2*i+3
    22    7.9297 MB  0.0000 MB       return [2]+[x for x in s if x]

line_profiler 和memory_profilerIPython中的简便实用方法

IPython中,只要你执行以下两个命令,皆可以直接实用line_profiler 和memory_profiler了:

%load_ext memory_profiler
%load_ext line_profiler

执行这两个命令以后,就可以通过执行%lprun 和%mprun命令来测试你需要测试的函数,而不需要在每个函数前面添加@profile标记,如下:

In [1]: from primes import primes
In [2]: %mprun -f primes primes(1000)
In [3]: %lprun -f primes primes(1000)

找到内存泄露的地方

cPython利用对象的引用计数来维护内存的使用,当某个对象被保存一次时,该对象的引用次数就会加1,某个对象被删除一次时,该对象的引用次数就减1,当引用次数为零时,删除该对象。

当某个对象已经不再使用了,但是他的引用还存在,那么就会出现内存泄露。

要检测内存泄露,这里我们需要用到模块objgraph ,使用下面命令安装该模块

pip install objgraph

(主要这个模块是要按照pythonxdot模块和graphviz程序)

在代码中使用一下代码打开调试模式:

import pdb; pdb.set_trace()

获取使用最多的前20个对象

使用下面的命令:

(pdb) import objgraph
(pdb) objgraph.show_most_common_types()

MyBigFatObject             20000
tuple                      16938
function                   4310
dict                       2790
wrapper_descriptor         1181
builtin_function_or_method 934
weakref                    764
list                       634
method_descriptor          507
getset_descriptor          451
type                       439

获取增加和删除的对象

使用下面的命令:

(pdb) import objgraph
(pdb) objgraph.show_growth()
.
.
.
(pdb) objgraph.show_growth()   # this only shows objects that has been added or deleted since last show_growth() call

traceback                4        +2
KeyboardInterrupt        1        +1
frame                   24        +1
list                   667        +1
tuple                16969        +1

那些对象被引用

以下面的代码为例:

x = [1]
y = [x, [x], {"a":x}]
import pdb; pdb.set_trace()

执行下面的命令:

(pdb) import objgraph
(pdb) objgraph.show_backref([x], filename="/tmp/backrefs.png")

输出下面的图片:

134916_5z1h_616678

图片最底下的红色字母表示的对象是我们做关系的,它显示了那么变量引用了这个对象。

总的说来,objgraph会告诉我们:

  • 占用内存的对象
  • 在一段时间内对象的增加和删除
  • 对象的所有引用

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