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云梯集群FileNotFound灵异事件追查始末

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FROM:http://luoli523.com/blog/2012/12/27/yun-ti-ji-qun-filenotfoundling-yi-shi-jian-zhui-cha-shi-mo/

集群最近出现了一个非常诡异的现象,问题的表象如下:

2012-12-04 01:23:30,225 INFO org.apache.hadoop.ipc.Server: IPC Server handler 32 on 9001, call submitJob(job_201211151327_2801259) from 172.24.208.67:52961: error: java.io.FileNotFoundException: File does not exist: hdfs://hdpnn:9000/home/hadoop/cluster-data/mapred/system/job_201211151327_2801259/job.xml
java.io.FileNotFoundException: File does not exist: hdfs://hdpnn:9000/home/hadoop/cluster-data/mapred/system/job_201211151327_2801259/job.xml
        at org.apache.hadoop.hdfs.DistributedFileSystem.getFileStatus(DistributedFileSystem.java:483)
        at org.apache.hadoop.mapred.JobInProgress.<init>(JobInProgress.java:303)
        at org.apache.hadoop.mapred.JobTracker.submitJob(JobTracker.java:3120)
        at org.apache.hadoop.mapred.JobTracker.submitJob(JobTracker.java:3084)
        at sun.reflect.GeneratedMethodAccessor54.invoke(Unknown Source)
        at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:25)
        at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:597)
        at org.apache.hadoop.ipc.RPC$Server.call(RPC.java:481)
        at org.apache.hadoop.ipc.Server$Handler.run(Server.java:1147)

从异常日志上来看,好象是说在提交job的时候,由于某个文件不存在,导致job提交失败。但深入调查发现:报不存在的那个文件,实际上早就存在了。有的时候,那个文件可能是几个星期前就已经写入到HDFS上了,却在某个时间发生这种问题。表现出来的现象就是这种File Not Found Exception。

从经验上来看,很有可能是由于同步问题导致,但令我们百思不得其解的是:如果是同步问题造成,那么可以解释刚创建的文件马上去getFileInfo会出现类似的现象,但无法解释很久以前就存在的文件还会报这种错误。这个问题在我们的集群上隐藏了很长时间,岁素想尽了各种办法都没有找到最终的原因,只能让失败的job重跑。更令人崩溃的是,重跑能重现的概率极低,导致我们线下模拟变得非常的困难。 不过功夫不负有心人,经过非常非常苦逼的各种蛛丝马迹的分析和模拟,终于找到了底层最终的原因。

疑惑:

这个bug是一个同步问题的bug,简单的说就是:namenode中所有对文件系统进行访问(读/写)都是加锁了,不修改namespace操作的加读 锁(getListing, getBlockLocations等),修改namespace结构的加读锁(mkdir,rename,create,delete等),唯一的一个 没有就是getFileInfo。之前怀疑就是因为这个同步问题造成的上述问题,但所有的表象中,最后剩下一个现象一直没法得到很合理的解释,那就是:

-rw-rw-rw-  10 jiangxiaohui cug-admin    8302325 2012-11-15 13:34 /home/hadoop/cluster-data/mapred/system/shared_cache/3ec34669545c607f549b291ddd490d4f_jython.jar

报文件不存在的这个文件,实际上在很早的时候就已经在HDFS的DistributedCache目录中了,job初始化的时候没有修改过,所以即使是同步问题,也无法解释很早就存在的文件为何get不到info。

另外由于这个问题在测试环境中一直没有找到稳定重现的办法,所以之前的调查只能说怀疑跟这个地方有关,但无法下绝对的结论。

重现:

经过对所有出现类似这种现象的日志进行观察,发现很大部分出现都是在对 /home/hadoop/cluster-data/mapred/system/shared_cache 这个目录下的文件进行getFileInfo的时候出现的,这个目录是云梯上的DistributedCache目录,他的特点是:

  1. 对该目录下的文件 进行ls操作非常的频繁;
  2. 在这个目录下进行getFileInfo的时候,随时可能还有其他的进程往这个目录里增删文件或者目录。

同时基于对某天出错时间点前后的 mapred/system目录以及mapred/system/shared_cache目录的audit log进行观察发现,虽然没有对3ec34669545c607f549b291ddd490d4f_jython.jar这个文件的修改操作,但那段时 间有比较频繁的对shared_cache目录下文件的增删操作。基于上述特点,我写了两个job尝试重现这种现象:

  1. 在实验集群上创建一个文件: /home/hadoop/cluster-data/mapred/system/shared_cache/3ec34669545c607f549b291ddd490d4f_jython.jar
  2. jobA:并行跑540个map,在map中循环不断的对这个文件进行getFileInfo操作(while true),其他什么都不干
  3. jobB:并行跑100个map,在map中不停的对mapred/system目录以及mapred/system/shared_cache目录进行文件的增删操作,循环往复。
    两个job都没有动过3ec34669545c607f549b291ddd490d4f_jython.jar文件,但运行一段时间后,问题重现了。

FileNotFoundException

分析原因:

重现以后,进一步跟踪,终于找到了深层次最终根本的原因。

IndexOutOfBoundException

namenode内部的namespace目录树结构是由一个一个的Inode组成,如果是目录,那么目录下的子INode是用一个children数组 保存的,所以要对一个目录下的某个文件进行getFileInfo操作,实际上就是找到那个目录的INode,并对该INode下的children数组 进行二分查找。出现问题的情况原因是: 由于getFileInfo没有加directory的读锁,导致在getFileInfo的时候,当对children数组进行二分查找时,并不是一个 排他的查找,有可能在查找的过程中,children数组内的内容以及发生了变化,可能多了一个或多个child,也可能少了几个,这样当 getFileInfo找到某个文件在children数组中的index,并尝试去get(idx)时,这两个操作之间如果发生了children变 化,同时该变化还导致了该文件在children中的index发生了变化,或者向上述日志一样直接就数组越界,就有可能造成getFileInfo的返 回不准确。

解决:

找到了深层次的原因,解决起来就比较好办了,patch修改如下:

getFileInfo_patch

getFileInfo_patch2

PS:patch的修改是基于淘宝云梯集群的代码,并不一定适用于其他base版本。需要特别提出的是:我们的hadoop版本处于性能的原因做了很多的优化,性能提升的同时也带来了一些寻常集群没有碰到过的问题,如果你的集群用的是CDH3,甚至CDH4的版本,里面namenode内部仍然用的是全局锁,性能虽然不高(相对而言),但通常不会出现这种问题

问过facebook的同行,他们同样存在这个问题,只不过他们的提交作业场景跟我们不太一样,所以发生的频率没我们这么高,上个月他们fix了这个问题,我们的代码也在上个月fix了这个问题(http://reviewboard.dev.sd.aliyun.com/ReviewBoard/r/68258/),我用fix后的版本再次运行job,再也没有出现过上述现象。​

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